个体工商户的个人所得税，在自然人申报管理系统里面申报。
1、企业先登录自然人申报管理系统，在界面上方选择个人生产经营所得。
2、在申报征收页面填写对应的收入、支出、费用、扣除项目等。
3、填写减免税额信息，如无则直接点击“下一步”。
4、最后点击右下角的“提交”按钮，弹出提示询问是否确认申报。点击提交就可以了。
