查账征收能够在一定程度上根据企业实际经营情况进行税款缴纳，实行多得多缴公平征收。而且，实行查账征收的企业还可以通过所得税汇算清缴，进行税款缴纳的多退少补。
而核定征收的企业则无需参加汇算清缴，从而减少了查账的费用和麻烦；因而，对于经营效益好的小规模纳税人企业来说，有可能会从中取得额外收益；但是对效益差的企业而言，则有可能会带来额外损失。所以应该根据企业的实际情况选择查账征收还是核定征收。
