商业贷款和公积金贷款的区别有：
1.他们的性质不同，公积金贷款主要以个人缴存的公积金为主，向缴存公积金的职工用于购买住房的住房保障型贷款，是一种政策性贷款，不一盈利为目的;而商业贷款是以房产等财产作为抵押物，向银行获得一次性借款的交易，是以赢利为目的。
2.它们的利率不同，公积金贷款的利率在5年(含)一下的期限，利率为2.75%，在5年以上，利率为3.25%。而商业贷款的利率普遍较高，在4%左右。
